Într-un viitor îndepărtat, omenirea a construit orașul-fortăreață mobil numit Plantation, pe un pustiu devastat. În interiorul orașului se află cartierele piloților, Mistilteinn, cunoscut și sub numele de „Colivia Păsărilor.” Acolo trăiesc copiii... Singura lor misiune în viață este lupta. Dușmanii lor sunt misterioasele organisme uriașe cunoscute sub numele de Kyoryu. Copiii operează roboți numiți FRANXX pentru a înfrunta acești inamici încă nevăzuți. Printre ei era un băiat care fusese cândva considerat un copil minune: Codul numărul 016, Hiro. Într-o zi, o fată misterioasă pe nume Zero Two apare în fața lui Hiro. „Te-am găsit, dragul meu.”